Στις συλλογές της Μονής Πρέβελη περιλαμβάνονται:

- Συλλογή εικόνων,

- Συλλογή αμφίων,

- Συλλογή εκκλησιαστικών σκευών,

- Συλλογή κειμηλίων.

Τα σημαντικότερα εκθέματα του Μουσείου της Μονής είναι:

- Σιγίλιο σε μεμβράνη, με θέμα την ανακήρυξη της Μονής σε σταυροπηγιακή, 1798,

- Σταυρός ευλογίας από επίχρυσο ασήμι, πολύχρωμο σμάλτο και ημιπολύτιμες πέτρες, 1708,

- Αργυρόδετο Ευαγγέλιο, 1807,

- Ευαγγέλιο με κάλυμμα από επίχρυσο ασήμι, 1847,

- Τετραευάγγελο με αργυρό κάλυμμα, 19ος αιώνας,

- Επίχρυσο δισκοπότηρο, με κάλυμμα, 1847,

- Συλλογή μεταλλικών σφραγίδων 19ου αιώνα,

- Συλλογή μεταλλικών πορπών, 19ου αιώνα,

- Συλλογή χρυσοκέντητων αμφίων, 19ου αιώνα,

- Συλλογή μεταλλικών εκκλησιαστικών λειτουργικών σκευών.