Συλλογές που περιλαμβάνει:

- Συλλογή αρχαϊκών στηλών,

- Συλλογή πορτρέτων Ρωμαίων αυτοκρατόρων,

- Συλλογή νεκροδείπνων,

- Κεραμεική (9ος αιώνας π.Χ. - 2ος αιώνας π.Χ.).

Σημαντικότερα εκθέματα:

- Μαρμάρινο καθιστό άγαλμα του Αιάκη. Στην επιγραφή αναφέρεται ότι αφιερώθηκε στην Ήρα από τον Αιάκη, πατέρα του Πολυκράτη, από τα κέρδη που είχε από την πειρατεία. Βρέθηκε στο Πυθαγόρειο. Γύρω στο 540 π.Χ.,

- Μεγάλη μαρμάρινη μνημειακή σαρκοφάγος στον τύπο ναόσχημου οικοδομήματος. Δεύτερο μισό 6ου αιώνα π.Χ.,

- Μικρή πώρινη επιτύμβια στήλη με ανθεμωτή επίστεψη και επιγραφή: ΔΙΑΓΟΡΟ ΤΟ ΓΔΗΛΟ. 530 π.Χ.,

- Μαρμάρινη επιτύμβια στήλη με ανθεμωτή επίστεψη. Βρέθηκε στη Χώρα, 500/490 π.Χ.,

- Μαρμάρινο άγαλμα του αυτοκράτορα Τραϊανού, υπερφυσικού μεγέθους. Ύψος 2.71 μ.,

- Μαρμάρινο πορτρέτο Αυγούστου, ύψους 0,49 μ.,

- Μαρμάρινο πορτρέτο Κλαυδίου, ύψους 0,53 μ.