Σώζεται όλος ο οχυρωματικός περίβολος της Μονής, ενισχυμένος με δέκα πύργους, ο οποίος περιβάλλει έκταση 5,5 στρεμμάτων. Το καθολικό, κτίσμα του α' τετάρτου του 11ου αι., σώζεται σε ύψος μέχρι και 4 μέτρα. Είναι σταυροειδής εγγεγραμμένος ναός, με δύο ταφικά παρεκκλήσια, και αποτελείται από τέσσερις οικοδομικές φάσεις. Η Εφορεία Αρχαιοτήτων Χαλκιδικής και Αγίου Όρους διενήργησε συστηματική ανασκαφή για την αποκάλυψη και μελέτη της οικοδομικής ιστορίας της μεσοβυζαντινής μονής του Ζυγού.