Η Υδρία της Πρωτοελλαδικής εποχής αποτελεί ένα από τα σημαντικά ευρήματα της αρχαιολογικής συλλογής. Προέρχεται από ναυάγιο στην περιοχή του Γαλαξειδιού και χρονολογείται στην 3η χιλιετία π.Χ. Είναι χειροποίητη. Διαθέτει σφαιρικό σώμα, δύο μικρές λαβές, κάθετες στο σώμα, και χαμηλό στενό λαιμό.